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Webinar: Proteomics Leader Explains How to Turbo-Charge Proteomics Studies with PepSep Columns
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PepSepシリーズはペプチドの分離に最適なカラムです。業界をリードする材料とコネクタを使用して作られ、様々なプロテオミクスアプリケーションをカバーするラインナップを提供しており、ユーザーのあらゆるクロマトグラフィのニーズに対応することができます。様々なUHPLCシステムで使用でき、HPLCシステムとエミッターとの接続も簡便に行うことができます。
4/8/15 cmの短いカラムを使用することで、高速な分離が可能になります。またシングルセルプロテオミクスには、高感度分析に特化したPepSep C18 25 cm × 75 µm、1.5 µm(50 ng未満)もラインナップされています。
PepSepULTRA:ルーチン分析からシングルセルプロテオミクスまで
PepSepXTREME:短いグラジエントと高いスループット
PepSepMAX:全てのプロテオミクスワークフローに対応
カラム充填剤にはクラス最高のReproSil C18 1.5 µm、1.9 µm、3 µm ビーズ(ポア径は100-120Å)を採用しており、カラムの設計はシンプルで信頼性の高いnanoConnectおよびUHP注入口接続で組み立てられています。HPLCおよび質量分析計へのスムーズかつ迅速な接続が可能で、各社イオン源にも接続できます。またスプレイヤーの分離構造によりカラムとエミッターを別々に交換可能で、様々なシステムに柔軟に対応します。
BrukerのtimsTOF Proによる測定ではPepSepはわずかな時間のうちに比類のない感度でこの上ない結果を示しました。標準サンプルを用いたテストでは平均で1000回以上の注入に耐えるなど、堅牢性にも優れています。
他社製のC18カラムとの比較ではPepSepはペプチドレベル(プレカーサ―)のピーク強度の再現性において優れた結果を示しています。
他社製C18カラムとPepSepカラムで各4回ずつ測定した結果の比較。PepSepではピークの半分以上がCV10%以下を示している。
測定条件
■流速:200nL/min ■測定モード:DIA ■サンプル:HEK293細胞のトリプシン消化物 200ng ■データ解析:DIA-NN
測定機器
Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480
UltiMate 3000 RSLCnanoシステム
データご提供元:公益財団法人かずさDNA研究所 ゲノム事業推進部 臨床オミックス解析ユニット ユニット長 川島 祐介 様
質量分析計の進化で技術的にも進歩し感度が高くなるにつれて、C18カラムも進化しています。 PepSepシリーズでは従来のC18カラムと比較して1.5 µmや1.9 µm径の樹脂が充填されており、理論段数が格段に向上して分離能が優れているため、より多くのペプチドの同定が可能になります。
timsTOF Proでの測定では、PepSep TWENTY-FIVEは30分のグラジエントで5,500を超えるタンパク質グループ、42,000のペプチドを同定しました。
timsTOF Proに接続されたnano Elute UHPLCを使用して、PepSep TWENTY-FIVEとw/5mm Thermo Pepmapトラップで200ngK562を測定した結果。デフォルトのDDAショートグラジエントMSメソッドを使用。データの解析はMSFraggerを使用
dia-PASEFⓇを使用したtimsTOF SCPにUHPLC Evosep Oneを接続し、Whisperメソッドでシングルセルプロテオミクス解析を実施した結果では500 pgの細胞消化物から2,000を超えるタンパク質が、また250 pgからは1,500のタンパク質がそれぞれ同定されました。250 pgから同定されたタンパク質は約4桁の存在量範囲をカバーし、シングルセルレベルでの定量的プロテオーム分析を可能にしました。
A)Evosep Whisperメソッドを使用して250 pgから25 ngのペプチド負荷の範囲のHeLa消化物の希釈系列から同定されたタンパク質
B)存在量ランクによるタンパク質分布は、約4桁のダイナミックレンジを示しています
C)250および500 pgのk562細胞から同定されたタンパク質の数は48回の連続実行で消化されます
品番 | 品名 |
PS-U | PepSepULTRA C18 25cm×75μm, 1.5μm |
PS-X | PepSepXTREME C18 25cm×150μm, 1.5μm |
PS-M | PepSepMAX C18 10cm×150μm, 1.5μm |
1895618 | PepSep C18 50cm × 75μm, 1.9μm |
1893625 | PepSep C18 15cm × 75μm, 1.5 μm |
1895806 | PepSep C18 15cm × 100μm, 3μm |
1893473 | (EV1112)Performance C18 15cm×75μm, 1.9μm |
1893474 | (EV1137)Performance C18 15cm×150μm 1.5μm |
1893471 | (EV1106)Endurance C18 15cm×150μm, 1.9μm |
1893480 | (EV1064)Endurance C18 8cm×100 μm, 3μm |
1893470 | (EV1109)Performance C18 8cm×150μm, 1.5μm |
1895619 | (EV1107)Endurance C18 4cm×150μm, 1.9μm |
1864965 | (EV1087)Fused Silica Emitter ID20μm |
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・PepSepカラムカタログ